ReNtブレイン リサーチ ネットワークのプロジェクト提案
(ブレント)
オープン ブレイン サイエンス: OPEN BRAIN SCIENCE
WEB上脳空間でデータを共有し、解析ツールを開発し、脳研究を活性化!
見えない遺伝子の存在を、見える形に・・・皆で共有できる情報に!

ReNtは、脳遺伝子発現図譜データベースViBrism を使った
オープンブレインサイエンスを提案します。
   ViBrism (ビブリズム)は・・・
トランスクリプトームトモグラフィーで作成した36,000以上の遺伝子発現を網羅した脳図譜データベースです。  
遺伝子発現量を3次元の脳解剖情報と合わせて俯瞰できます。
遺伝子を、Gene Symbol/ ID, 発現部位と量の類似性で検索できます。 >>  RIKEN  ViBrism-DB
3次元図譜の例はこちら                                                 >>     Examples 

ランスクリプトームモグラフィーTranscriptome Tomography:TT)を使うと
実験条件に合わせて個別にViBrism-DB が作れます。    >>  お問い合わせはこちらへどうぞ

                                                               
 プロジェクト#1 紹介     

OPEN BRAIN SCIENCE
・実験装置の共有
・実験データの共有
・解析ツールの共有
・研究成果活用の活性化

多くの人が情報交換し、
複雑な脳の理解を進め、
難しい脳疾患の治療への確かな一歩を。

BReNt-はViBrism-DB から始めます。
ACTIVATE ViBrism !

ヒトの脳研究に欠かせない、
モデル動物について、
今より100倍詳しい発現地図を作ります。

これを INCFの提案する国際標準脳空間
Waxholm SpaceMRI・組織染色画像等と比較します。

脳には全遺伝子の85%以上が発現し、それらの組み合わせで、複雑な活動を巧みに制御しています。 

どんな遺伝子について、脳機能について、知りたいですか?

共同研究提案はこちらへ

ViBrismデータを使った解析紹介

  • TT法について、YouTubeビデオで分かりやすく説明しています 「遺伝子を脳構造にマップする」 http://youtu.be/3a951otikWsPublished on Apr 9, 2014網羅的遺伝子発現情報を3次元空間に再構成する新手法「トランスクリプトーム・トモグ­ラフィー(TT法)」の紹介動画です。TT法は・・・
    投稿: 2014/09/15 0:20、BReNt Admin
  • ViBrism-DB の遺伝子発現マップの例 線条体に発現している遺伝子の例 (c) 2012 Y Okamura-Oho
    投稿: 2012/09/21 1:05、BReNt Admin
  • Video C:任意の脳領域をViBrism空間に仮想的にマップする方法 ここでは、BrainStars で解析されている46領域をマップする例をビデオで紹介します。詳細については、site-editor@brent-research.org に、お問い合わせください。
    投稿: 2012/07/27 5:58、BReNt Site-Editor
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お知らせ

  • Transcriptome Tomography の論文がScientific Reports (NPG, オープンアクセス誌)に掲載されました。 Article "Broad Integration of Expression Maps and Co-Expression Networks Compassing Novel Gene Functions in the Brain" in Scientific Reports
    投稿: 2014/11/29 5:59、BReNt Site-Editor
  • Transcriptome Tomography の論文がPLOS ONE に掲載されました ViBrism-DB の遺伝子発現地図を作成した方法(トランスクリプトームトモグラフィー)についての論文がPLOS ONE (9月19日付け, 日本時間9月20日)に掲載されました。(CC) 2012 Yuko Okamura-Oho et.alhttp://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0045373
    投稿: 2012/09/20 6:04、BReNt Site-Editor
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ブレント
DNAについて分かりやすく説明した絵本を、電子書籍 で出版しました